顯微鏡是一種精密測量儀器，它使學生能夠觀察極其微小的生物體並研究其微生物形態。顯微鏡的主體由光學部分和機械部分組成，其中光學部分最為重要。顯微鏡的光學部分主要由物鏡和目鏡組成。兩者結合，即可形成清晰的觀察影像。

1. 數值孔徑。

數值孔徑，又稱孔徑比，主要指物體與透鏡之間介質的折射率與透鏡孔徑一半的正弦值的乘積，是顯微鏡的重要參數之一。通常認為數值孔徑越大越好，提高數值孔徑主要有兩種方法：一是不斷增加孔徑角，二是提高白介質的折射率。

2. 決議。

解析度是反映顯微鏡性能的主要參數之一。一般來說，人眼能夠觀察分辨的物體距離約為0.073毫米。如果距離更小，則難以分辨。顯微鏡的工作原理與人眼類似，其最小解析度也有數值表示。解析度也與數值孔徑有關，而數值孔徑又由兩個因素決定：數值孔徑和光源波長。數值孔徑越大、波長越短，解析度越高。

3. 放大倍率。

顯微鏡物鏡和目鏡的放大倍率以鏡身上的數字和字母表示，顯微鏡的總放大倍率是指兩者的乘積。使用顯微鏡時，物鏡和目鏡需要搭配使用。使用目鏡時，應注意補償目鏡與物鏡的協調配合。補償目鏡上也標有特定的字母，需要與消色差物鏡搭配使用。

4. 工作距離。

工作距離主要指顯微鏡調焦後物鏡下表面與蓋玻片上表面之間的距離。物鏡放大倍率越大，工作距離越短。舉例來說，放大倍率小於10倍的低倍物鏡的工作距離約為6mm，而百倍物鏡的工作距離則小於0.2mm。一位學生在實驗中，由於持續使用高倍物鏡，在調焦不準確的情況下，出現了切片破碎的問題。隨著顯微鏡機械結構的不斷成熟，這個問題有望得到根本解決。除了上述主要參數外，顯微鏡的性能參數還包括景深、盲點覆蓋率、視場、鏡面亮度、清晰度等。這些直接或間接的參數都與顯微鏡的觀察效果密切相關。